Mantovani ha gestito lo sviluppo complessivo del progetto per la realizzazione del Centro di protonterapia di Trento: oltre alla progettazione, si è occupata anche della sua costruzione e delle fasi di collaudo. La protonterapia è una forma avanzata di trattamento oncologico che utilizza fasci di protoni per curare numerose tipologie di cancro: si sfrutta l’estrema precisione delle particelle consentendo di mantenere intatte le strutture sane non colpite dal tumore e di limitare effetti collaterali tipici delle cure oggi più in uso. Il Centro protonico di Trento, eccellenza italiana per il trattamento dei tumori e uno dei pochi centri di protonterapia avanzata attualmente operativi nel mondo, ha un volume complessivo di 64mila metri cubi ed è in grado di seguire circa mille pazienti ogni anno. Mantovani attualmente partecipa anche alla gestione del centro protonico.